為使本院員工擁有更多圖書資源，本館與臺大醫院圖書館及陽明交通大學圖書館館際合作。
一、館際合作服務一覽表
| 服務項目 | 臺大醫院圖書館 | 陽明交大圖書館 |
|---|---|---|
| 圖書借閱 | 憑借閱證至臺大醫圖借書 1.每證可借閱5冊 2.每冊借期4周，不得續借 3.逾期罰款每日5元
註：臺大醫圖借閱證請至總館櫃台借證 |
憑借閱證至陽大圖書館借書 1.每證可借閱5冊 2.每冊借期4周，需續借請提前告知 3.逾期罰款每日5元
註：陽大圖書館借閱證可至各院區借證 |
| 代借代還 | 使用者自負郵費 | 免費，每人3冊為限 |
| 文獻複印 |
每頁收費5元 急件另收40元 |
免費 |
二、臺大醫院圖書館館際合作服務要點
1.比照臺大醫圖與臺北榮總醫院圖書館合作模式，雙方協議圖書互借、代借代還、館際文獻互印等合作項目，並另外訂定服務要點。
2.短期閱覽證優惠：北市聯圖讀者於臺大醫圖申請「短期閱覽證」時，得比照臺大專任教職員工(含附設醫院)之直系親屬，持足以證明身分之文件即享有五折優惠。
3.講習課程：北市聯圖讀者得比照臺大醫圖讀者，免費參加臺大醫圖舉辦之各項講習課程。
三、陽明交大學圖書館館際合作服務要點
1.讀者委託代借圖書須線上填寫申請表，載明個人資料、書名、索書號及條碼號。每人可借書3冊，借期30天，可續借1次。
2.讀者須於通知後，到代借館辦理借閱手續。圖書保留至下次聯醫公務車收送代借代還圖書之前一日；逾期未取者，除不予保留外，並將累計其紀錄，每二次逾期未辦理借閱者，則停止其申請圖書代借代還權利半年。
3.讀者可直接至代還館辦理還書。
4.遇圖書逾期情況，依典藏館之圖書借閱規則辦理；代還館代收罰金，並列印收據給讀者。罰款、罰款收據證明與代還圖書一起送至典藏館。